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Dernière mise à jour : Mai 2018

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Genetique Animale et Biologie Integrative

Unité Mixte de Recherche INRA AgroParisTech GABI Génétique Animale et Biologie Intégrative

L'UMT eBIS labellisée en 2017 associe trois partenaires, l’INRA-GABI, l’Institut de l’Elevage et Allice au sein de l’équipe G2B.

Unité Mixte Technologique eBIS
Cette UMT fait suite à l’UMR 3G qui rassemblait les mêmes partenaires pour mettre en œuvre la sélection génomique dans toutes les populations, une technologie qui a complètement renouvelé la sélection bovine. Le nouveau projet prolonge le précédent mais intègre les nouveaux enjeux de la sélection associés aux changements globaux, aux évolutions technologiques, mais aussi aux évolutions réglementaires.

Cette UMT labellisée en 2017 associe trois partenaires, l’INRA-GABI, l’Institut de l’Elevage et Allice au sein de l’équipe Génétique et Génomique Bovine de GABI. Son projet concerne les grandes évolutions attendues à la fois en termes de méthodologie mais aussi de nouvelles applications de l'évaluation génomique des reproducteurs. Il est adapté aux grandes décisions en cours, avec l'application du Règlement Zootechnique Européen (RZUE) en novembre 2018 qui modifie très sensiblement les missions réglementaires de l'INRA et de Idele dans le domaine de la sélection des bovins.

Le programme comprend quatre champs

  • Le champ 1 aborde d'une part la réalisation des évaluations génétiques bovines et leurs évolutions dans le cadre réglementaire actuel ; d'autre part, toutes les actions à mettre en œuvre pour préparer une transition vers le nouveau cadre aussi efficace et satisfaisante que possible pour les utilisateurs. Par la suite, les activités du champ 1 se poursuivront, pour faciliter les échanges avec le futur Service d’Evaluation Mutualisé.
  • Le champ 2 aborde divers enjeux méthodologiques de la sélection génomique. Un effort majeur sera consacré à l'utilisation des données de séquence : prise en compte les mutations causales, inclusion des effets non additifs des gènes dans les prédictions et évaluation génétique en croisement, mais aussi analyse de l'impact des phénomènes épigénétiques dans les prédictions. Ce champ abordera aussi d'autres enjeux méthodologiques comme la généralisation du single step ou la prédiction des interactions génotype x milieu.
  • Le champ 3 est dédié à l'analyse génétique des caractères, avec deux types de travaux : 1) l’étude des phénotypes qui présentent un gros enjeu pour la durabilité des productions bovines ; les travaux prioritaires concernent l'efficacité alimentaire, la production de méthane, la santé des animaux et la qualité des produits. 2) la recherche d’anomalies génétiques et gènes d’intérêt, qui s’appuie sur l’Observatoire National des Anomalies Bovines (ONAB), et sur des détections issues directement de l’analyse des séquences.
  • Enfin, le champ 4 traite des outils d'aide à la décision pour tirer parti de la sélection génomique, tout particulièrement à l'échelle intra troupeau dans un cadre où la majorité des femelles est génotypée. Des travaux sont conduits pour revisiter les plans d'accouplement, minimiser la consanguinité et éviter les anomalies ; pour prédire la carrière future des animaux et aider ainsi à la décision pour la politique de réforme et de reproduction ; adapter les prédictions au système de production en prenant en compte à la fois les différences d'objectifs de sélection et les interactions génotype x milieu.

Cette thématique s’intègre très naturellement dans le métaprogramme Inra Sélection génomique qui est une source d’activités pluridisciplinaires, de partage entre espèces, voire de règnes, et d’ouverture internationale, vers le Nord comme vers le Sud.

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